圣地牙哥--(美国商业资讯)--Arima Genomics, Inc.是专注於促进基因体结构资讯在医学研究、诊断和治疗中应用的生物科技公司，该公司今天宣布，植基於现有Arima-HiC平台的HiChIP应用已全面上市。随着此次上市，研究人员现在能从单次实验获得在感兴趣的蛋白占据的基因体位点上特别丰富的长距离染色质相互作用，从而能加快发现和发表速度并降低成本。
此次上市代表已完成成功的市场开发和Beta测试计画，由此衍生出市场需求的进一步证据、强化品质管制提升产品性能，并提供来自客户验证的宝贵回馈意见。Mayo Clinic生理学教授Tamas Ordog表示：“我们对经由Arima HiChIP方案获得的资料感到非常满意。”关键意见领袖、Case Western大学教授、Case综合癌症中心成员Peter Scacheri表示：“结果显示出很高的可重复性和出色的整体品质，该试剂盒节省了时间和定序成本。我们特别重视直截了当的品质管制步骤和易用性，整体而言，Arima HiChIP具有重大价值。我们对Arima-HiChIP资料的资讯性质和品质感到满意。”
HiChIP资料能为基因调控的机制基础及其如何最终导致疾病状态提供资讯。Sanford Burnham Prebys长老会医学发现研究所发育、老化和再生计画教授Lorenzo Puri表示：“透过H3K27ac或H3K4me4 HiChIP丰富的活跃染色质功能，我们发现了高解析度的染色质环化事件，这些事件在健康状态、老化或肌肉营养不良等疾病的肌肉再生过程中，可促进肌肉干细胞从静止状态过渡到致力於分化成再生肌纤维的过程中的基因控制。”
认识到HiChIP的价值且在缺乏经商业验证之试剂盒的情况下，科学界一直在自制这种生物化学。研究神经精神病学遗传学的加州大学旧金山分校助理教授Yin Shen表示：“我们一直在自制HiChIP，因为它可提供以往分别进行HiC和ChIP-Seq实验所获得的关键见解。在最具挑战性的终末分化神经元样本中，我们的自制版本之前失败了，即便使用此类样本，Arima-HiChIP仍可生成卓越的资料品质和可重复性，因此为我们节省了可观的重复成本。”
早期客户产生的回馈意见和资料也有助於了解HiChIP在相关分析（例如HiC和ChIP-Seq）背景中的定位。特别是，尽管HiC可反映基因体组织的全域架构，但HiChIP可丰富源自於研究感兴趣的特定基因体位元点的目标染色质相互作用。根据研究的要求，研究人员能充分利用全方位HiC、更高解析度的HiChIP或两者。Puri补充道：“HiChIP资料与我们全基因体HiC资料的综合分析，对於理解影响基因调控之更广泛的区室化和拓扑架构以及特定顺式调控元件之间更精细的解析度联系至关重要。”
重要的是，由於来自HiChIP的染色质相互作用资料以叁维方式反映基因体的固有折叠（和错误折叠），因此这也可以为重新排列的癌症染色体上的基因调节错误提供资讯，这是传统ChIP-Seq实验所缺少的重要见解。Scacheri补充道： “我们不仅观察到跨癌症基因体的染色体内顺式调控相互作用，而且还观察到重排染色体上染色体间的异位顺式调控相互作用。我们认为，该资料将有助於加强勾勒癌症中基因与表观基因驱动子事件之间的关系。”
为了回应客户对资料分析的需求，该公司与学术伙伴合作，以促使经学界验证的开源生物资讯学工具最佳化，例如MAPS。Arima MAPS产品线可自动输出易於理解的品质管制统计资料，并在使用者按下按钮后继续生成染色质相互作用热图和弧形图，以便在基因体浏览器中轻松查看。除了简化的资料分析之外，该公司还专注於加强客户服务和支援体验，这是其为加快样本至发现和发表工作而不断努力的一部分。Ordog补充道：“Arima技术支援团队非常出色。”
该公司在其现有Arima-HiC平台上开发HiChIP，从一个通用Arima试剂盒同时支援HiC和HiChIP。此外，该公司已扩大业务规模，并强化商业团队，以便在全球发售这些试剂盒。Arima Genomics商业总监Joseph Spidle表示：“经客户验证的Arima-HiChIP试剂盒和服务的上市代表重要的里程碑，因为它既可以达成目标HiC方法的商业化，又是对传统ChIP-Seq的升级。我们的目标是在促使基因体结构见解可用性大众化的同时，为Arima-HiC平台添加有临床意义和科学意义的应用，以促进基础研究和疾病相关研究。”
关於Arima Genomics
Arima Genomics, Inc.是一家生物科技公司，其目标是促进对基因体定序和结构及其在健康、疾病、物种演化中角色的了解。欲了解进一步资讯，请造访：http://www.arimagenomics.com。
原文版本可在businesswire.com上查阅：https://www.businesswire.com/news/home/20200316005137/en/
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联络方式：
Siddarth Selvaraj
执行长，Arima Genomics
sid@arimagenomics.com
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